在细胞内，几乎所有的生物过程都离不开蛋白质与配体的相互作用（protein-ligand interactions）。这些配体可以是小分子药物、代谢物、脂类、甚至金属离子。深入理解这些相互作用不仅有助于揭示信号通路、调控机制和疾病机制，更是药物发现、靶点验证以及机制研究的关键一步。然而，蛋白-配体相

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无标记定量蛋白质组学（Label-free Quantitative Proteomics, LFQ）因其样本准备简便、适用范围广、成本相对较低，成为当前生物医学研究中的主流定量策略。然而，LFQ数据质量和重复性问题始终是制约其应用深度和可靠性的关键因素。在本文中，我们将系统解析影响LFQ数据表现的

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无标记定量蛋白质组学（Label-Free Quantitative Proteomics）作为研究生物系统中蛋白表达动态变化的重要工具，已广泛应用于疾病机制研究、药物靶点发现及生物标志物筛选。在无标记定量策略中，数据依赖采集（Data-Dependent Acquisition, DDA）与数据独

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靶向代谢组学作为代谢组研究中的核心策略之一，凭借其高灵敏度、高特异性和高重复性，已广泛应用于生命科学、医学研究和临床转化等多个领域。然而，任何技术都有其两面性，靶向代谢组学也存在一定的局限性。 一、靶向代谢组学的主要优势 1、高灵敏度与高特异性检测 靶向代谢组学基于多反应监测（MRM）或选择性反应

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非靶向代谢组学（Untargeted Metabolomics）是一种以全面扫描样本中尽可能多的代谢物为目标的分析策略，强调广覆盖、无偏倚、探索性的特征。它主要用于未知代谢物的发现、代谢通路筛查和疾病机制研究，在生命科学、医学、营养学和药物研发等领域具有广泛应用价值。在技术实现上，非靶向代谢组学通常

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在蛋白质尤其是治疗性蛋白药物（如单抗、融合蛋白、酶类等）中，二硫键（Disulfide Bond）是一种维持蛋白质空间结构和功能活性的重要共价键。其连接模式的正确与否，直接关系到蛋白折叠效率、稳定性、免疫原性甚至药效。由于在重组表达和制剂开发过程中，二硫键易出现错配（mispaired）、断裂（cl

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抗体（Immunoglobulin, Ig）是一类高度复杂的糖蛋白，由两条重链和两条轻链组成。它们之间的稳定连接不仅依赖于非共价相互作用，更关键的是通过二硫键（Disulfide Bonds）形成共价连接。这些二硫键既存在于链内（intrachain disulfide bonds），也存在于链间（

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随着4D蛋白组学（Four-Dimensional Proteomics）技术在标志物发现、药物研发及临床转化研究中的广泛应用，DIA（Data Independent Acquisition）已成为主流的定量采集模式。基于离子迁移谱（Ion Mobility, IM）的4D DIA策略，在大幅提升

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引言：精准识别N端序列，为蛋白研究打下基础 在蛋白质研究中，氨基酸序列的精确鉴定是理解其功能与结构的第一步。虽然现代质谱技术已在蛋白质组学领域大放异彩，但在某些特定场景下，一种经典的序列分析方法依然不可或缺——Edman降解（Edman degradation）。这种以化学方

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在抗体药物的研发过程中，蛋白质序列的准确解析是确保药物功能与安全性的核心环节。然而，抗体分子N末端的化学修饰或结构异常（即“N末端阻断”）常导致传统测序技术失效，这一问题已成为抗体开发领域长期存在的技术瓶颈。Edman降解作为一种经典的N端测序方法，凭借其独特的化学特性，在应

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